1. 有机物 ：实验用水中若存在部分有机物会降低色谱柱的工作效率，甚至会缩短色谱柱的寿命。而且一些有机污染物还容易被电离，在电离时会与样品产生反应，从而对实验结果造成不良的影响。比如：实验中常常出现基线漂移，背景噪音过高、图谱分析发现较多杂峰等现象，多数都是因为纯水中的有机物所致。
2.离子：纯水中的离子主要是酸根离子及矿物离子，这些离子容易与有机试剂结合形成结晶盐，甚至会堵塞色谱柱的管路甚至损伤色谱柱；在实验过程中造成离子叠加峰；部分特殊离子比如：钾离子等还具有一定的吸收紫外线的能力。
3.颗粒物:颗粒物的危害比较大，因为他的存在可以增大系统被压，堵塞色谱柱管路，磨损色谱泵从而缩短色谱柱寿命。但一般情况下，在超纯水中存在颗粒的颗粒物几率相对不大。
4.微生物 : 微生物也是造成影响HCLP色谱分析法的因素之一，前端进水中的微生物如果形成菌膜，将会持续增殖并产生有机分泌物。这些分泌物会直接影响到实验结果。
由此看来，衡量HPLC分析实验用水的主要指标是TOC值和电阻率，当TOC值小于10ppb，电阻率值大于等于18.2就可以。对比了实验室用水中指标后发现，只有部分实验室超纯水符合该指标，普通的双蒸水、去离子水、桶装水，甚至于RO纯水都不用于HPLC分析实验。
采用的是IPAK Meta和IPAK Quanta组合纯化柱。以及Jetpore混床离子交换树脂和创新的IQ nano 离子交换混合填料，可以有效去除水中离子至痕量级。紫外灯的设计也有所改善，采用了使用氙激发技术发射 172nm波长紫外光的新型紫外灯，使氧化效率大幅提高，从而降低TOC含量，提升水质。 并且配置高精度的A10 TOC检测模块：TOC值的检测精确到0.1ppb
2.离子：纯水中的离子主要是酸根离子及矿物离子，这些离子容易与有机试剂结合形成结晶盐，甚至会堵塞色谱柱的管路甚至损伤色谱柱；在实验过程中造成离子叠加峰；部分特殊离子比如：钾离子等还具有一定的吸收紫外线的能力。
3.颗粒物:颗粒物的危害比较大，因为他的存在可以增大系统被压，堵塞色谱柱管路，磨损色谱泵从而缩短色谱柱寿命。但一般情况下，在超纯水中存在颗粒的颗粒物几率相对不大。
4.微生物 : 微生物也是造成影响HCLP色谱分析法的因素之一，前端进水中的微生物如果形成菌膜，将会持续增殖并产生有机分泌物。这些分泌物会直接影响到实验结果。
由此看来，衡量HPLC分析实验用水的主要指标是TOC值和电阻率，当TOC值小于10ppb，电阻率值大于等于18.2就可以。对比了实验室用水中指标后发现，只有部分实验室超纯水符合该指标，普通的双蒸水、去离子水、桶装水，甚至于RO纯水都不用于HPLC分析实验。
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