反渗透纯水机的工艺流程主要包括以下几个步骤：
一、预处理阶段
- 原水储存：通过原水罐储存原水，用于沉淀水中的大泥沙颗粒及其它可沉淀物质。同时缓冲原水管中水压不稳定对水处理系统造成的冲击。
- 原水泵：恒定系统供水压力，稳定供水量。
- 多介质过滤器：采用多次过滤层的过滤器，主要目的是去除原水中含有的泥沙、铁锈、胶体物质、悬浮物等颗粒在20μm以上的物质。可选用手动阀门控制或者全自动控制器进行反冲洗、正冲洗等一系列操作。
- 活性炭过滤器：系统采用果壳活性炭过滤器，活性炭不但可吸附电解质离子，还可进行离子交换吸附。经活性炭吸附还可使高锰酸钾耗氧量（COD）降低，同时去除水中的色素、异味、大量生化有机物，降低水的余氯值及农药污染物，除去水中的三卤化物（THM）以及其它的污染物。可选用手动阀门控制或者全自动控制器进行反冲洗、正冲洗等一系列操作。
- 离子软化系统/加药系统：为防止浓水端特别是RO装置最后一根膜组件浓水侧出现CaCO₃、MgCO₃、MgSO₄、CaSO₄、BaSO₄、SrSO₄、SiSO₄的浓度积大于其平衡溶解度常数而结晶析出，损坏膜原件的应有特性，在进入反渗透膜组件之前，应使用离子软化装置或投放适量的阻垢剂阻止碳酸盐、SiO₂、硫酸盐的晶体析出。
- 精密过滤器：采用精密过滤器对进水中残留的悬浮物、非曲直粒物及胶体等物质去除，使RO系统等后续设备运行更安全、更可靠。滤芯一般为5μm熔喷滤芯，目的是把上级过滤单元漏掉的大于5μm的杂质除去。
二、核心处理阶段
- 反渗透系统：反渗透装置是用足够的压力使溶液中的溶剂（一般是水）通过反渗透膜（或称半透膜）而分离出来，因为这个过程和自然渗透的方向相反，因此称为反渗透。反渗透膜孔径仅为0.0001微米，能去除有害的可溶解性固体及细菌、病毒等，脱盐率达99.6%以上，生产出符合国家标准的纯净水。
三、后处理阶段
- 臭氧杀菌器（可选）：杀灭由二次污染产生的细菌，彻底保证成品水的卫生指标。臭氧具有强氧化性，有灭菌、氧化、脱色、除味四大功能，用于水的消毒时，浓度在4mg/L时，0.5~1分钟即可杀灭全部细菌。同时臭氧溶于水后形成富氧水，保证了水的纯鲜，又不失水的活性。
- 紫外线杀菌装置（可选）：利用紫外线照射杀灭水中的微生物，进一步保证水质的卫生和安全。
整个工艺流程中，每一级处理都至关重要，它们共同协作以确保最终产出的纯净水质量达到高标准。同时，设备的运行和维护也需严格按照操作规程进行，以延长设备的使用寿命并保证水质的持续稳定。