制药纯水机生产的纯化水和注射用水，在水质标准上既有相同点，也有不同点：
相同点
- 微生物限度要求：两者都对微生物有严格限制，以确保药品生产过程不受微生物污染。《中国药典》规定，纯化水微生物限度需控制在每 1ml 中需氧菌总数不得过 100CFU ；注射用水微生物限度为每 100ml 中需氧菌总数不得过 10CFU 。这是因为微生物在药品生产中可能引发药品变质、影响疗效，甚至对患者健康造成严重威胁。
- 不溶性微粒：都要求水中不溶性微粒尽可能少，以避免这些微粒在药品生产过程中影响药品质量，如堵塞过滤设备、影响药品外观等。
- 酸碱度：纯化水和注射用水对酸碱度都有一定范围要求，以保证其化学稳定性，避免对药品生产过程产生不良影响。纯化水 pH 值应符合 5.0 - 7.0 ；注射用水 pH 值同样规定在 5.0 - 7.0 。
不同点
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化学纯度：
- 注射用水：对化学纯度要求更高。例如，注射用水的电导率在 25℃时，一般要求不超过 1.3μS/cm ，这样严格的电导率要求旨在最大程度减少水中离子杂质，确保用于注射剂生产时不会因离子存在影响药品稳定性和安全性。
- 纯化水电导率：在 25℃时一般要求不超过 5.1μS/cm ，相对注射用水标准稍宽松。
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热源与内毒素：
- 注射用水：必须严格控制热源和内毒素。热源是微生物产生的能引起恒温动物体温异常升高的致热物质，内毒素是革兰氏阴性菌细胞壁中的脂多糖，进入人体会引发发热等不良反应。注射用水内毒素含量规定每 1ml 中不得超过 0.25EU 。
- 纯化水：对热源和内毒素无明确要求，因为其一般不直接用于注射剂生产。
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制备工艺：
- 注射用水：通常通过多效蒸馏水机或蒸汽压缩蒸馏水机等方法制备，这些方法能有效去除水中的热源、微生物和各种杂质，确保水质符合高标准。
- 纯化水：制备方法相对多样，如离子交换法、反渗透法、超滤法等，去除水中杂质和离子的程度相对注射用水制备工艺稍低。